Таб.04 spl Элайнмент структур U6 мяРНК
5 ' Stem/Loop ************************************************************************ * 10 20 * 30 40 50 * *...GUUCGCGAAG.. UAACC. ..CUUCGUGGACAU * UUGGUCAAUUUGAAACAAUACAGAGAU * S.c. *..AGUCCAUAUUACC CUCCGU GGUUUUAUGGACAU * UUGGUCAAUUUGAAACAAUACAGAGAU * K.l. *GCAGCCC........ .UUCG. .......GGGACAU * CCA.CAAACUGGAAAUUCAACAGAGAA * Trip * C........ .UUCG. .......GGGACAU * CCGAUAAAAUUGGAACGACACACAGAA * Bean *...GUUCU....... .UCCG. .......AGAACAU * AUACUAAAAUUGGAACAAUACAGAGAA * Worm * * * *...GuyC........ .uYcG. ........GrACAU * .YR.u.AA.UuGRAAcra.ACAGAGA. * Cons ************************************************************************ 5 ' Концевой домен Центральный домен Приведены выравненные последовательности S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Bean (Vicia faba), Trip (Trypanasoma brucei), K.l. (Kluyveromyces lactis), Worm (Caenorhabditis elegans). РНК произвольно разделена на четыре домена. Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U4. (СМ. ДАЛЕЕ) Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988Смотрите также:
