Таб.05 spl Элайнмент структур U6 мяРНК
Stem I Stem II ************************************************************************ * 60 70 80 * 90 100 110 * *GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGAU * GAACCGUUUUACAAA....GAGAUUUAUUUCG..UUUU *S.c. *GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGAU * GAACCGUUUUACAAA....GAGAUUUAAGA....UUUU *K.l. *GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGCU * GAUGU......CAAUCUUCGAGAUUUAUAGC...UUUU *Trip *GAUCAGCA UGGCCCCUGCGCAAGGAU * GACACG...CACAAA..UCGAGAUUUAUAGCAAAUUUU *Bean *GAUCAGCA UGGCCCCUGCGCAAGGAU * GACACG.....CAAA.UUCGUGAAGCGUUCCAAAUUUU *Worm * * * *GAUYAGCA ...cCCCUGCRYAAGGaU * GA..cg.....CAAa....G.GA..YR...c...UUUU *Cons ************************************************************************ домен взаимодействия с U4 3' концевой домен Приведены выравненные последовательности S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Bean (Vicia faba), Trip (Trypanasoma brucei), K.l. (Kluyveromyces lactis), Worm (Caenorhabditis elegans). РНК произвольно разделена на четыре домена. Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U4. Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988Смотрите также:
