Таб.05 spl Элайнмент структур U5 мяРНК


Ia        IL1        Ib     Stem/Loop I  IL2    IC   LoopI  Ic' 
**************************************************************************

*         10       20- 30        40   50-70     80         90 -100-110   *

*AA.GCAGCUUUAC AGA.. -CGAGGUCAACAUC. AA--UU AUAACGAAC AUGGUUCU -- CAU
CCG*S.c. 
*CA.GCCG............ ..UGUGAUGAUGACA ------ .UAGCGAAC UA.UCUUU -- AUA
GUC*Pea 
*AU.ACUC............ ....GUUUCUCUUCA ------ .GAUCGUAU AAAUCUUU -- UUU
CCG*Mouse 
*AU.ACUC............ ....GUUUCUCUUCA ------ .GAUCGCAU AAAUCUUU -- UUU
CCG*Human 
*                                                                        *

*R...C........................u...Ca ------ ..r.CG.aY .a.uYUuU ** .u.
CYG*Cons 
**************************************************************************

5 ' Концевой домен  Часть 1. 
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Pea, Mouse, Human. 
Указанные позиции соотнесены с последовательностью дрожжей. 
РНК произвольно разделена на два домена. 
Знак - указывает на пропущенные в данной таблице участки. 
Расшифровка обозначений сайтов и участков дана в тексте записи.
(СМ. ДАЛЕЕ
) Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

Смотрите также:

  • U5 мяРНК