U5 мяРНК
U5 мяРНК (см. рис. Структура U5 мяРНК) варьирует по длине в двухкратном размере (от 107 до 214 н-дов). Молекула имеет двухдоменную структуру: 5' концевую спираль и 3' концевой домен, содержащий одноцепочечный участок, включающий в себя сайт связывания Sm и участок стебель/петля ( см. таб. ). 3' концевой участок стебель/петля значительно варьирует по длине и составу и является филогенетически изменчивым и функционально незначимым (по крайне мере у дрожжей) ( Patterson, 1987).
В структуре U5 доминирует длинный спиральный элемент обозначенный как stem I ( см. рис ). Он разделяется на несколько подструктур. Концевая петля (Loop I) поддерживается двумя главными стеблями (Ic, Ib), разделенными внутренней петлей (IL2), а вторая внутренняя петля (IL1) отделяет стебель Ib от короткого стебля Ia ( см. рис ). Максимальная консервативность найдена в верхней части этой структуры. Петля I имеет длину в 11 нуклеотидов, 9 из которых инвариантны ( см. таб ). Элемент IL2 содержит участки абсолютной гомологии как с 3' так ис 5' стороны стебля.
U5 является наиболее структурированной из сплайсосомальных РНК, что вероятно обьясняет чрезвычайно низкую степень консервативности первичных структур. Так, за исключением Sm сайта , консервативность перичных структур ограничивается петлями I и IL2. Эти участки являются првлекательными кандидатами для специфического связывания с интрон-связывающим белком (IBP) , U5-зависимым белком, взаимодействующим с 3' сайтом сплайсинга последовательность-специфичным образом ( Gerke V., 1986 , Tazi J., 1986 ). В этом отношенни интересно, что S. cerevisiae U5 РНК специфически осаждается с 260 kd белком, который требуется для сплайсинга ( таб. ).
Смотрите также:
