Таб.07 spl Элайнмент структур U1 мяРНК


5' SS       Long
Rec.       Range            Stem/Loop I                  Stem/Loop II 
**************************************************************************

*        10 *        20          30         40           50         60   *

*AUACUUACCUU*AAGAU AUCAG..AGGA. GAUCAAGAAG .UCCUACUGAU                  
*S.c. 
*AUACUUACCUG*GCAGG GGAGAC.ACCAU GAUCAGGCAG GUGGU.UUUCC
.CAGGGCGAGGCUCAU--*Chick 
*AUACUUACCUG*GCAGG GGAGAC.ACCAU GAUCACGCAG GUGGU.UUCCC
.CAGGGCGAGGCUCAU--*Mouse 
*AUACUUACCUG*GCAGG GGAGAC.ACCAU GAUCACGCAG GUGGU.UUUCC
.CAGGGCGAGGCUCAU--*Human 
*           *                                                            *

*auACUUACCUg*r...r r..........r gA.Cr..aAg .y....y...Y
.yrG...r.....Y..--*Cons 
**************************************************************************
 5 ' Концевой                    Центральный домен
домен  Часть 1.
 
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
Chicken, 
Mouse, 
Human. 
Указанные позиции соотнесены с последовательностью дрожжей. 
РНК произвольно разделена на два домена. 
Знак - указывает на пропущенные в данной таблице участки. 
Расшифровка обозначений сайтов и участков дана в тексте записи. 
(СМ. ДАЛЕЕ) 
Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988


Смотрите также:
  • U1 мяРНК
    • 

  • РНП-РНП взаимодействия
    •