U1 мяРНК
На сегодняшний день для всех организмов, за исключением дрожжей, размер и генетическая организация U1 очень консервативны ( Reddy R., 1988 ) ( см. таб ., рис .): 5' одноцепочечный участок , содержащий последовательности комплементарные 5' сайту; за ним следует участок дальних взаимодействий; центральный домен , содержащий три структуры стебель-петля, обозначенные как I, II и III; 3' концевой домен состоит из одноцепочечного Sm сайта , за которым следует концевая структура стебель-петля , обозначенная как IV. Общий размер U1 варьирует между 165 (mouse) и 147 (Schizosaccharomyces pombe). Только U1 S. cerevisiae сильно отличается по длине и имеет 568 н-ов.
Из таблицы можно видеть строгую гомологию для всех видов U1 в пределах 5' концевого участка (50 нуклеотидов для дрожжей), включающую 9/10 совпадений для млекопитающих в одноцепочечной петле I. Однако, генетический анализ показывает, что у дрожжей по крайней мере 196 нуклеотидов могут быть делетированы между 3' концом структуры стебель/петля I и Sm сайтом.
Абсолютная консервативность 5'-структуры стебель/петля I прекрасно согласуется с данными, показывающими, что этот участок является главной детерминантой распознавания мяРНП-специфических белков U1-70k и U1-A ( Hamm J., 1987 ).
Очень важно знать конкретные участки U1 участвующие в спаривании в процессе сплайсинга. Предложено несколько схем спаривания: первая - (нуклеотиды 65-72 для U1 и 30-37 для U2) требует участия петлевых последовательностей спирали II ; вторая - (U1 - 11-20; U2 - 5-14). Неудача в поиске длинных, консервативных областей потенциального спаривания подразумевает, что U1/U2 взаимодействие определяется множественными короткими участками. Эта модель согласуется с результатом, что низкоуровневое кросс-иммуноосаждение мяРНП чувствительно к изменениям в любом изученном структурном домене U2 ( Mattaj I.W., 1986 ).
Смотрите также:
