ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.4. Tal/Twist/Atonal/Hen
Другие семейства (кроме 1.2.1 , 1.2.2 , 1.2.3 ) класса транскрипционных факторов с основным доменом типа спираль-петля- спираль ( Basic-helix-loop-helix , bHLH ) труднее идентифицировать с использованием обычных методов выравнивания аминокислотных последовательностей. Как правило, сходство, выявляемое между этими факторами, зависит от того, какие участки аминокислотных последовательностей используются для анализа (полные bHLH- домены , отдельно взятые основные области, первая или вторая альфа-спираль и т.д.).
В связи с этим для классификации аминокислотных последовательностей был использован алгоритм, основанный на учете корреляций между позициями bHLH-доменов ( Terhalle et al., готовится к печати ). С его помощью в рассматриваемом классе было выявлено три дополнительных семейства bHLH-факторов.Первое из них ( 1.2.4 ) содержит: подсемейство лимфоидных факторов , подобных Tal-1 (Tal/Twist/Atonal/Hen) (1.2.4.1); подсемейство мезодермальных регуляторов развития , подобных Twist ( 1.2.4.2 ); подсемейство HEN-факторов , Atonal , панкреатические факторы ; всего 27 факторов); ( 1.2.4.3 ); подсемейство Atonal-родственных белков ( 1.2.4.4 ), а также подсемейство панкреатических факторов ( 1.2.4.5 ). Наряду с особенностями аминокислотных последовательностей, свойственных ТФ каждого подсемейства, все они имеют ряд общих свойств, в том числе, наличие ароматического остатка (Phe, Tyr или His) в позиции 40 и длину петли между двумя альфа-спиралями в пределах 10-11 а.о.
Смотрите также:
