ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС bHLH: ТФ 1.2
Класс транскрипционных факторов с основным доменом типа спираль-петля-спираль ( Basic-helix-loop-helix , bHLH )
Подобно факторам bZIP , белки bHLH контактируют с ДНК посредством своего положительно заряженного района. Они взаимодействуют с ДНК в форме гомо- или гетеродимера, формирующегося с помощью олигомеризационного домена типа спираль-петля-спираль [ Ferre-D'Amare A.E. et al., 1993 , Ellenberger T. et al., 1994 , Anthony-Cahill S.J. et al., 1992 ].
К ДНК-связывающему участку полипептидной цепи, обогащенному основными аминокислотными остатками, примыкают две амфипатические альфа-спирали, соединенные друг с другом полипептидными петлями разной длины. Мотив "спираль-петля-спираль" (HLH) обеспечивает димеризацию факторов и их взаимодействие с ДНК, а область факторов, обогащенная основными аминокислотами, определяет специфичность ДНК-белкового взаимодействия. Во время димеризации альфа-спирализация полипептидных цепей факторов может значительно усиливаться, а после связывания димеров с ДНК основные домены также альфа-спирализуются. В димере все четыре HLH-домена, по- видимому, ориентированы параллельно друг другу.
В этот класс не включаются ТФ, которые помимо домена bHLH имеют еще и " лейциновую застежку ", выступающую в качестве дополнительной димеризационной структуры, расположенной ближе к концу полипептидной цепи. Эти факторы выделены в отдельный класс ( 1.3 ).
В класс ТФ 1.2 входят следующие семейства:
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.1.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.2.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.3.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.4.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.5.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.6.
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.7. (INO ( INO2 , INO4 );
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.8(факторы, содержащие только HLH-домен Emc , Id1 , Olf-1 ; всего девять факторов);
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.2.0. (другие bHLH-факторы ( Deliah , Lc , CBF1)
Общее число известных факторов в классе - 82.
Смотрите также:
