Вирусная ДНК
Протяженность вирусных ДНК варьирует в широких пределах от 2-3 тысяч до 250000 н.о. Самые большие вирусные геномы содержат несколько сотен генов, а самые маленькие - информацию, достаточную для синтеза лишь нескольких белков.
В структуре геномных вирусных ДНК всегда присутствует несколько функциональных участков, которые обеспечивают репликацию , транскрипцию и транспорт генома к месту сборки.
Функциональный участок, обеспечивающий репликацию вируса, обычно называют ori (от англ. origin - начало). Появление такого участка обусловлено тем, что для эффективной работы ДНК-полимераз требуется затравка со свободным З'-гидроксилом, т.к. ДНК-полимеразы способны только удлинять имеющуюся затравку и не способны инициировать синтез de novo. В простейшем варианте ген ori - это участок ДНК для инициации работы праймазы (затравочной РНК-полимеразы) . У некоторых вирусов в качестве затравки используется так называемый концевой белок. Например, у представителей группы аденовирусов для инициации репликации используется 5'-терминальный Т-белок ( р55 ).
Основной репликативной формой ДНК являются двухцепочечные кольцевые молекулы. Однако вирионные формы ДНК могут быть представлены в виде двух- или одноцепочечных структур и резко отличаться от репликативной двуспиральной кольцевой структуры. Для перевода вирионной формы ДНК в репликативную в составе вирусной ДНК широко представлены специальные последовательности - прямые и инвертированные повторы, которые за счет процессов рекомбинации обеспечивают формирование репликативных кольцевых структур.
Второй очень важный структурный компонент генома - это участки, которые обеспечивают доставку и упаковку вирусной ДНК в капсид.
Третий функциональный домен вирусных ДНК - это участки, обеспечивающие процессы транскрипции генетического материала. Сюда входят промоторы , энхансеры , участки терминации транскрипции , сигналы полиаденилирования , участки, обеспечивающие сплайсинг и посттранскрипционную модификацию РНК .
И наконец, в составе любой вирусной ДНК присутствуют уникальные кодирующие последовательности вирусных генов. Необходимо отметить, что у вирусов эукариотических организмов синтезирующаяся мРНК способна обеспечить синтез только одной полипептидной цепочки, т.е. имеет свойства моноцистронной матрицы, хотя может содержать кодирующие последовательности для нескольких полипептидов. Гены могут располагаться как на одной кодирующей цепочке ДНК, так и мозаично на разных цепях двухцепочечных молекул.
Смотрите также:
