Папилломавирусы: классификация

По данным Национального бюро клеточных исследований США и медицинской сети Medline, насчитывается более 170 различных типов папилломавирусов ( табл. 2.16 и рис. 2.35 ) и число их непрерывно растет. Вирусы папилломы человека (ВПЧ) классифицируют несколькими способами, например по локализации папилломавирусных инфекций (тропизму). Выделяют, отдельную группу папилломавирусов, ответственных за образование кожных бородавок . Построено филогенетическое древо соответствия ВПЧ, которое показывает степень родства папилломавирусов по нуклеотидной последовательности участка MY09/MY11 L1 гена вирусного генома . Типы ВПЧ, онкогенные по половому тракту ( ВПЧ 16 и ВПЧ 18 ), принадлежат к различным ветвям этого древа, и аналогичные им типы вирусов группируются рядом с ними. Так, например ВПЧ 18, 45, 59, 70, 39, 68, 54 группируются в одну группу, а ВПЧ 16, 33, 58, 67 образуют другую группу, при этом ВПЧ 31, 35, 52 близки к группе, образованной "вокруг" ВПЧ 16. Вирусы ВПЧ 6 и 11, ассоциирующие с папилломатозом половых органов и гортани , образуют отдельную ветвь вместе с аналогичными им типами ВПЧ (61, 11, 44, 55, 13). ВПЧ 6 и 11 эволюционно очень близки, что не наблюдается в случае наиболее распространенных вирусов, ассоциированных с опухолями наружных половых органов (ВПЧ 16 и 18).

Некоторые супергруппы представляют собой родственные папилломавирусы животных. Супергруппы A и Е объединяют родственные папилломавирусы животных и человека, что свидетельствует о двукратной инвазии папилломавирусов животных в человеческую популяцию.

Построение такого филогенетического древа позволяет выделить несколько групп родственных папилломавирусов, относительно которых необходимо тщательное исследование их онкогенных свойств. На рис. 2.35 представлено обновленное филогенетическое древо, на котором выделено 16 родов семейства Papillomaviridae .