Таб.10 spl Элайнмент структур U2 мяРНК


IIb  IIb'  IIa'       Sm Site            Stem/Loop III       Stem/Loop IV
               
************************************************************
 70     80  90       100         110 - 130       140 -  160         170   
* 
 --------------AUACA CAUUUUUUGG CACCC--CUUG CUAUCUUUCCGAC--..UCGCACUUGU..-
* S.c. 
 --------------CG... GAUUU.UUGG GCGCG--CUUG CUCCCUCCGCUCC--UAUGGCAGU.ACCU-
*Chic 
 --------------UG... GAUUU.UUGG AAGUA--CUUG CUCCCUCCACUCC--UAUUGCAGU.ACCU-
*Mouse 
 --------------UG... GAUUU.UUGG AGCAG--CUUG CUCCCUCCACUCC--UAUUGCAGU.ACCU-
*Human 
                                                                          
* 
  --------------y.... .aUUU.UUgg .....--CUUG
CU.Y.....Y.yy--..UygCA.U.Ry..-*Cons
               
************************************************************
3' концевой домен  
Часть 2.
 
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Chicken, Mouse, Human.  
РНК произвольно разделена на три домена 
(3', 5' концевые и центральный домены. 
Знак - указывает на пропущенные в данной таблице участки. 
Расшифровка обозначений сайтов и участков дана в тексте записи. 
 Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

Смотрите также:

  • U2 мяРНК
  • U5 мяРНК
  • Таб.09 spl Элайнмент структур U2 мяРНК