ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС bHLH/ZIP: ТФ 1.3
Класс факторов типа спираль-петля-спираль/лейциновая застежка ( bHLH/ZIP )
ДНК-связывающий участок обогащен остатками основных аминокислот, к которому примыкают две амфипатические альфа- спирали, соединенные полипептидной петлей, а также домен типа "лейциновая застежка". HLH-мотив обеспечивает димеризацию факторов, необходимую для их взаимодействия с ДНК. В димеризации также участвуют остатки Leu мотива "застежка". У факторов, связавшихся с ДНК, значительно усиливается альфа-спирализация полипептидных цепей. В димерах HLH-домены ориентированы параллельно друг другу. Область, обогащенная основными аминокислотами, обеспечивает специфичность взаимодействия факторов с ДНК.
На основании структурно-функциональных характеристик в этом классе можно выделить два разных семейства.
Первое из них ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.3.1. включает подсемейства повсеместно встречающихся или, по крайней мере, достаточно распространенных ТФ, большинство из которых постоянно присутствуют и активны. Известные подсемейства в составе этого семейства ( TFE-3 ( 1.3.1.1 ) и USF (SREBP , AP-4 ; всего 16 факторов); ).
Второе семейство ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: СЕМЕЙСТВО: ТФ 1.3.2. содержит четыре подсемейства факторов, контролирующих клеточный цикл . Здесь наблюдается попарная функциональная связь: факторы из подсемейств c-Myc ( 1.3.2.1 ) и Mad/Max ( 1.3.2.2 ) гетеродимеризуются друг с другом. То же происходит и с факторами из подсемейств E2F ( 1.3.2.3 ) и DRTF ( 1.3.2.4; всего 26 факторов).. Особенно сильно различаются аминокислотные последовательности факторов E2F и DRTF , для которых не найдена консенсусная последовательность по bHLH домену . Они были отнесены к этой группе исключительно на основании топологических соображений.
Общее число известных факторов в классе - 42.
Смотрите также:
