ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС: ТФ 4.5 белки, связывающиеся с TATA боксом
Класс факторов, связывающихся с ТАТА-боксом
В настоящее время этот класс содержит единственное семейство - ТАТА-связывающих белков ( TBP ) ( 4.5.1 ). Для полипептидов характерны консервативный С-концевой и дивергировавший N-концевой участки. Последний необходим для взаимодействия с промоторами Pol II и Pol III , содержащими TATA- бокс, но не с промоторами Pol I , в которых эта последовательность отсутствует. Может связывать ДНК в виде мономера, сгибая молекулу; входит в состав различных TAF .Существуют значительные видоспецифичные различия в N-концевой части аминокислотных последовательностей TBP, например у человека и дрозофилы. Кроме того, у некоторых организмов имеется более одного гена TBP (Arabidopsis thaliana и пшеница).
ДНК-связывющий домен фактора TBP представлен обширным бета-слоем, имеющим седловидную структуру, которая охватывает ДНК, внедряясь в малую бороздку . При этом ДНК значительно деформируется в направлении большой бороздки [ Nikolov D.B. et al., 1992 , Kim Y. et al., 1993 , Kim J.L. et al., 1993 ], изгибаясь почти на 90 градусов.
Смотрите также:
