NURF Комплекс белков ремоделинга хроматина
SWI/SNF - не единственный фактор ремоделинга хроматина, имеющийся в эукариотических клетках. Идентифицированы десятки различных комплексов ремоделинга хроматина, в том числе NURF, NURD , ACF и CHRAC ( Vignali et al., 2000 ). Эти комплексы можно подразделить на несколько основных групп на основе идентичностей их АТФазных субъединиц. Комплексы SWI/SNF содержат АТФазы, родственные SWI2/SNF2 ; комплексы ISWI (например, NURF , CHRAC и ACF ) содержат АТФазы, родственные Imitation-SWI ( ISWI ); наконец, комплексы CHD (например, NURD ) содержат АТФазы, родственные CHD1 и Mi2 .
Комплекс NURF (nucleosomere-modeling factor, фактор ремоделинга нуклеосом) мобилизует нуклеосомы в активных генах у Drosophila. Полагают, что такие зависящие от АТФ энзимы ремоделинга хроматина , как NURF, являются антагонистами активностей комплекса компенсации дозы ( DCC , dosage compensation complex).
Комплекс NURF был выделен из эмбрионов дрозофилы ( табл. I.6 ). Оба комплекса состоят из нескольких субъединиц, обладают ATPазной активностью и влияют на контакты между гистонами и ДНК. У этих комплексов отсутствуют общие компоненты, они различаются по механизмам стимуляции ATPаз. Видимо, эти комплексы действуют на разные субстраты и могут функционировать независимо друг от друга.
Белковый комплекс NURF впервые был описан как кофактор фактора транскрипции GAGA, который необходим для активации промотора гена теплового шока дрозофилы hsp70. In vivo в этом промоторе была обнаружена последовательность длиной в 200-300 нуклеотидов с повышенной чувствительностью к ДНКазе, в состав которой входят TATA-бокс и сайты связывания факторов GAGA и HSF (heat shock factor - фактор теплового шока).
Гиперчувствительность промотора к действию ДНКазы можно было моделировать в бесклеточных экстрактах как до, так и после сборки хроматина путем добавления GAGA-фактора и ATP. Поскольку фактор GAGA сам по себе не обладает ATPазной активностью, в результате очистки белков с этой активностью и был идентифицирован комплекс NURF. Этот комплекс может разрушать нуклеосомы или изменять их положение в промоторе гена HSP70 и в отсутствие фактора GAGA. Однако присутствие NURF стимулирует связывание этого фактора со своим сайтом на промоторе, что, в свою очередь, ускоряет перестройку нуклеосом в этом участке гена. ATPазная активность NURF не стимулируется свободной ДНК или гистонами, однако усиливается в присутствии интактных нуклеосом, что отличает этот фермент от ATPазы Swi2.
При микросеквенировании пептида с молекулярной массой 140 кДа в нем был обнаружен ATPазный домен, гомологичный таковому Swi2, однако это оказалось единственной гомологией между двумя комплексами.
Специфичность функционирования ATP-зависимых белковых комплексов, изменяющих структуру нуклеосом, предполагает их точную доставку в нужные места хроматина. Специфический характер взаимодействия комплексов с ДНК обеспечивается дополнительными белками. Комплекс Swi/Snf входит в состав холофермента РНК- полимеразы II, что обеспечивает его доставку к соответствующим промоторным последовательностям. Было показано, что этот комплекс может взаимодействовать с рецептором глюкокортикоидов и в таком виде оказывать влияние на структуру нуклеосом. Формирование таких комплексов, по-видимому, является одним из существенных моментов активации рецепторов глюкокортикоидов. Учитывая взаимодействие рецепторов стероидных гормонов с ацетилазами / деацетилазами гистонов, можно полагать, что специфическое изменение структуры хроматина является общим механизмом, посредством которого рецепторы оказывают влияние на экспрессию соответствующих генов.
См. " БЕЛКИ trxG, УЧАСТВУЮЩИЕ В АТФ-ЗАВИСИМОМ РЕМОДЕЛИРОВАНИИ ХРОМАТИНА ".
Смотрите также:
