LINE (long interspersed elements) ДНК повтор


LINE-последовательности заключают в себе гены обратных транскриптаз, что является признаком ретротранспозонов (мобильных генетических элементов животных, обладающих структурным сходством с геномом ретровирусов ), но для них характерно отсутствие последовательностей длинных концевых повторов ( LTR - long terminal repeats), типичных для ретротранспозонов. В качестве примера LINE-последовательности можно упомянуть LINE1 повтор мыши и L1-повтор человека.

Длинные повторы изначально были описаны как последовательности ДНК длиной более 5 kb и представленные более чем 104 копиями на геном ( Singer, 1982 ). В геноме человека было обнаружено только одно семейство повторов LINE - L1 ( Hutchison et al, 1989 ). Консенсусная последовательность этих повторов имеет длину около 6 kb, так называемый poly-A "хвост" на одном конце и фланкирована короткими прямыми повторами обычно менее 20 н.п. длиной. Число копий - примерно 100,000 на гаплоидный геном. Большинство этих повторов усечены на 5'-конце.

Смотрите также:

  • Поиск и классификация альфа - сателлитных повторов
  • MECP2-белки человека: общие сведения
  • Повторы в эукариотическом геноме
  • Разнообразие теломер
  • Диспергированные повторы (SINE, LINE)
  • Функциональная значимость избыточной ДНК
  • HeT-A ретротранспозон дрозофилы
  • Мобильные элементы