Ген 6-16: активация транскрипции интерфероном

Человеческий ген 6-16 ( Porter et al., 1988 ) кодирует гидрофобный белок с молекулярным весом 12кД неизвестной функции. Он хорошо индуцируется a и b- интерферонами . Этот механизм не нуждается в белковом синтезе ( Kusari and Sen, 1987 ).

Показано, что последовательности внутри тандемных повторов (-89/-168) имеют большое значение для индукции интерфероном гена 6-16. Эти повторяющиеся последовательности 39 н.п. и 41 н.п. различаются только одним динуклеотидом СТ в позициях -138,-139 ( Porter et al., 1988 )

Каждый повтор включает одну копию 14-нуклеотидного ISRE (GGGAAAATGAAACT), СААТ-бокс , ТААТ-бокс и сайт для старта транскрипции. Эти тандемные повторы (две копии голова к голове) могут вызывать индукцию гена HSVtk .

Даже одной копии такого повтора достаточно для индукции. Cohen et al. (1988 ) получил подобные результаты для ISRE человеческого гена 2',5'-олиго А синтетазы . Это указывает на то, что ISRE содержит достаточную информацию для осуществления индукции экспрессии.

Участок от -71 до -62 включает инвертированный ССААТ-бокс, который необходим для транскрипции.

В 5'-концевой области гена 6-16 находится сайт связывания Sp1 ( Dynan et al., 1985 ), гомологичный таким же участкам ряда других IFN-индуцибельных генов и энхансерам SV40 и человеческого гена b-IFN .

Последовательность из 14 нуклеотидов (GGGAAAATGAAACT) имеет высокую гомологию с 5'-концевыми последовательностями других IFN-индуцибельных генов и гена b-IFN. Такой олигонуклеотид способен конкурировать с повторяющимся блоком в 39 н.п. за формирование комплекса, индуцируемого интерфероном.

Мотив GGAAA , находящийся в этой последовательности, найден в различных хорошо охарактеризованных энхансерах.