ДНК участок IRSE
Зависимые от интерферона 1 типа гены как 6-16 , ISG-54 и другие в своей 5'-концевой области содержат похожую последовательность, которая, по-видимому, участвует в интерферонзависимой активации транскрипции.
Эта последовательность найдена в промоторах большинства генов, стимулируемых IFN-альфа [ Gilmour K.C. et al., 1995 ].
Первоначально эта последовательность была обнаружена в генах HLA и металлотионеина ( Friedman and Stark, 1985 ), а затем в ряде интерферонзависимых генов. Она была названа Interferon Response Sequence (IRS, или ISRE ). Эта последовательность присутствует в самом гене b-IFN .
Эти 13- или 14-нуклеотидные IRSE последовательности высоко гомологичны (консенсус: G/AGGAAAN(N)GAAACT), промоторные фрагменты, содержащие их, связывают in vitro IFN-индуцированные и основные транскрипционные факторы ( Cohen et al., 1988 ; Levy et al., 1988 ; Porter et al., 1988 ).
В 5'-регуляторной области (-77/-36) гена b-IFN , названной Interferon Gen Regularory Element ( IRE , Goodbourn et al., 1986 ) был также найден повторяющийся гексануклеотидный мотив (AAGTGA) ( Fujita et al., 1985, 1987 ). Авторы полагают, что этот мотив регулирует связывание транскрипционных факторов ( Miamoto et al., 1988 ). В мышиных клетках к нему присоединяется белковый фактор IRF-1 . Тот же самый повтор может быть найден в области ISRE.
Работы Porter et al. (1988 ) показывают, что олигонуклеотид GGGAAAATGAAACT конкурирует с IRS-областью гена 6-16, а олигонуклеотид GGGAAAATGACACT (с одной заменой) - нет.
В лаборатории молекулярных основ онкогенеза ИМБ РАН были проведены работы по сравнению области IRS интерферонзависимых генов и гена c-myc . Было обнаружено, что консенсусная последовательность регуляторной области интерферонзависимых генов, GGAAAN GAAA, также присутствует в 5'-концевом участке человеческого гена c- myc в позициях -76/-67. Эксперименты по транскрипции in vitro в плазмидах, содержащих c-myc, показывают, что этот консенсусный участок конкурирует с двухцепочечным олигонуклеотидом GGGAAAATGAAACT за связывание специфических белков.
Для связывания фактора DRAF1 с промоторами генов, эффективно индуцируемых вирусами, критическое значение имеют последовательности ISRE, фланкированные с 5'-конца тремя нуклеотидами аденина [ Daly Ch. et al., 1995 ].
Последовательности ISRE в промоторах гена Мх1 мыши и гена МхА человека не содержат таких фланкирующих аденинов [ Hug H. et al., 1988 , Chang K.C. et al., 1991 ] и, по-видимому, не связывают, либо слабо связывают DRAF1. В отличие от DRAF1, для связывания DRAF2 достаточно консенсусной последовательности ISRE [ Daly Ch. et al., 1995 ]. Однако, участие DRAF2 в активации транскрипции ISGs вирусами требует дополнительных исследований.
Смотрите также:
