Сравнительная геномная гибридизация (СГГ)
Сравнительная геномная гибридизация (СГГ) - это применение метода FISH для широкого скрининга генома с целью выявить различия в числе копий любых нуклеотидньп последовательностей ДНК у пациента. СГГ была разработана для генетических исследований в сфере онкологии (первичные солидные опухоли), но в настоящее время применяется для определения локализации избыточного генетического материала или зон выпадения участков хромосом при предполагаемых хромосомных аномалиях. Метод заключается в смешивании и одновременной гибридизации равных количеств меченной различными красителями тестируемой ДНК (например, меченной зеленым флюоресцирующим красителем) и нормальной референтной ДНК (например, красный флюоресцирующий краситель) с нормальными нитями в метафазe. В результате получают определенное соотношение зеленой и красной флюоресценции. При этом зоны амплификации тестируемой ДНК (многократного копирования) выявляются как зоны избыточной концентрации зеленого красителя; зоны выпадения - как красные участки, отражающие дефицит тестируемой ДНК, а при равном соотношении тестируемой и нормальной ДНК имеются области желтого цвета. Таким образом CГГ позволяет получить карту нуклеотидных последовательностей ДНК в геноме. К преимуществам метода относится возможность его применения к любой ткани. Метод не может выявить сбалансированные хромосомные аномалии при которых количество копий ДНК не меняется. Разрешающая способность метода не позволяет идентифицировать хромосомные копии размером меньше 10 Мбт; а также изменения числа копий, если выпадение участков хромосом или избыточный хромосомный материал содержатся менее чем в 50% анализируемых клеток.
Смотрите также:
