G6PD-Ген
Gene: [0Xq28/G6PD] glucose-6-phosphate dehydrogenase
Ген Г-6-ФД расположен на Х-хромосоме . Таким образом, недостаточность Г-6-ФД наследуется сцепленно с Х-хромосомой. В 1981 году Persico M.G. клонировал кДНК Г6ФД (G6PD) на основе мРНК, выделенной из первичной культуры фибробластов человека ( Persico M.G.,1981 ).
В 1986 году Takizawa T. создал библиотеку кДНК Г6ФД (G6PD), используя поли-А мРНК из печени человека и гепатомы. Клоны кДНК не были полноразмерными, перекрывающиеся клоны из 2,44 килобаз содержали информацию для кодирования 362 аминокислот, т.е. 70% информации ( Takizawa T.,1986 ).
Ранее в 1977 году Yoshida A. на основе пептидного секвенса установил первичную структуру Г6ФД (G6PD) аминокислотной последовательности из 531 аминокислоты.
В 1986 году Persico M.G. клонировал кДНК, создав библиотеку кДНК из клеток HeLa ( Persico M.G.,1986 ). Полученная кДНК из 2624 пар оснований содержала 5' нетранслируемую область из 577 пар оснований, включающую ATG кодон. В данной области содержание GC достигало 73,2%, в 3' области - 64,1%, в кодирующей части - 59,5%. На основе кДНК была эмпирически выведена аминокислотная последовательностьполипептида из 479 аминокислот с предполагаемым молекулярным весом 55126 дальтон.
В 1986 году Martini G. клонировал геномную ДНК размером около 100 килобаз, включая весь ген Г6ФД (G6PD) ( Martini G.,1986 ).
Ген глюкозо-6-фосфат дегидрогеназы (G6PD) человека состоит из 13 экзонов и 12 интронов, что составляет по протяженности 18 килобаз. Первый интрон (550 bp) расположен в 5' нетранслируемой области гена на расстоянии 116 нуклеотидов от инициирующего кодона. Размер экзонов варьирует от 12 от 236 пар оснований, а размер интронов колеблется от 97 пар оснований до 11 килобаз. Более полная информация о размере экзонов и интронов приведена в таблице ( Таблица G6PD int ).
Промоторная область гена содержит последовательность ATTAAAT в позиции -202 за 20 пар оснований перед 5'концом, выполняя функцию TATA бокса. В промоторной области гексануклеотидная последовательность GGGCGGG представлена 3 раза, а комплементарная ей последовательность CCCGCCC - 6 раз. Данные последовательности обычно локализуются на расстоянии 12-400 пар оснований от ATTAAAT последовательности в генах. В гене Г6ФД последовательность GGGCGGG расположена на расстоянии 70 пар оснований от 5' конца и находится внутри 1 интрона, ниже 5' экзон-интронного сочления на 10 пар оснований. CAAT элементы , регулирующие уровень транскрипции выявлены в GC обогащенной области на расстоянии 220 пар оснований от 5'конца гена. ATTG последовательностиь локализуется в позиции -411.
Аминокислотная последовательность глюкозо-6-фосфат дегидрогеназы (Г6ФД, G6PD) была выведена на основе нуклеотидной последовательности кДНК ( Persico M.G.,1981 ; Persico M.G.,1986 ; Takizawa T.,1986 ; Hirono A.,1988 ).
На рисунке ( Рис. G6PD seq ) представлены нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена глюкозо-6-фосфат дегидрогеназы человека.
В 1991 году Chen T.Y. секвенировал нуклеотидную область размером около 20114 пар оснований, включающую ген глюкозо-6 фосфат дегидрогеназы. В гене глюкозо-6-фосфат дегидрогеназы выявлено 16 Аlu последовательностей, что составляет 24% нуклеотидной последовательности гена ( Chen E.Y.,1991 ). Alu повторы встречаются в трех точках гена: три Alu элемента и один неполный Alu элемент локализованы в 5'нетранслируемой области гена, 12 Alu элементов расположено в самом большом втором интроне.
В 1988 году была клонирована кДНК глюкозо-6-фосфат дегидрогеназы крысы ( Ho Y.S.,1988 ), дрозофилы ( Fouts D.,1988 ).
Gene: [0Xq28/G6PD] glucose-6-phosphate dehydrogenase
Ген Г6ФД расположен на Х-хромосоме . Таким образом, недостаточность Г6ФД наследуется сцепленно с Х-хромосомой.
Смотрите также:
