Биология опухолей: словарь терминов
Амплификация - образование нескольких копий гена. Этот процесс встречается при нормальном развитии, а также при утрате контроля за транскрипцией онкогенов, например гена МУС .
Антисмысловые нуклеотиды - фрагменты ДНК или РНК, комплементарные кодирующей последовательности гена или мРНК. Связываясь с ДНК и РНК, антисмысловые нуклеотиды могут нарушать транскрипцию и трансляцию. Эти вещества используются также в лабораторной диагностике.
Ген - участок ДНК, кодирующий белок.
Генная вставка - перемещение фрагментов вирусной ДНК или собственной ДНК клетки. Вставка может содержать промотор , вирусные или клеточные онкогены , из-за чего нарушается регуляция экспрессии генов или контроль за клеточным циклом и происходит опухолевая трансформация клетки. Вставка кодирующей последовательности может вести к образованию химерных белков. Длинные концевые повторы - мощные промоторы, способные активировать близлежащие гены, отвечающие за деление клетки.
Гетерогенная РНК - смесь молекул РНК различной длины, большую часть составляет недавно синтезированная РНК, из которой вырезаются интроны перед образованием мРНК .
Гибридома - искусственная опухоль, образующая моноклональные антитела . Она состоит из гибридных клеток, полученных путем слияния нормальных мышиных лимфоцитов, выделяющих антитела, и клеток плазмоцитомы , не образующих антител. Лимфоциты берут из селезенки мыши после введения ей антигена, например лейкоцитов человека. Один лимфоцит образует антитела лишь к одному антигену. Лимфоциты не делятся, но способны выжить в специальной среде, не пригодной для клеток плазмоцитомы. Гибридные клетки образуют антитела и делятся в этой среде, а клетки, не прошедшие гибридизацию, гибнут. Затем гибридные клетки разделяют и дают им размножиться, чтобы получить клон клеток, образующих нужные антитела.
Гомологичные участки ДНК и РНК содержат одинаковые или комплементарные последовательности нуклеотидов.
Двойные микрохромосомы - небольшие внехромосомные скопления ДНК без центромер, видимые под микроскопом. Признак амплификации генов в опухоли.
ДНК-полимеразы - ферменты, соединяющие дезоксинуклеотиды в цепь ДНК, в качестве матрицы используется вторая цепь. Осуществляют репликацию и репарацию ДНК.
Интрон - фрагмент гена, не кодирующий аминокислоты . После транскрипции интроны образуют петли, которые затем удаляются и разрушаются; в мРНК интроны не попадают. Очевидно, интроны нужны для регуляции транскрипции; из них могут возникать новые последовательности нуклеотидов, обеспечивающих генетическое разнообразие. В генах ретровирусов интронов нет.
Киназы - ферменты, фосфорилирующие белки и нуклеотиды.
Кодон - последовательность трех нуклеотидов, кодирующая аминокислоту или стоп-сигнал при трансляции РНК.
Комплементарные ДНК и РНК содержат кодоны, соответствующие друг другу как зеркальное отражение, и сцепляются друг с другом. ДНК и РНК используют как молекулярные зонды для обнаружения комплементарных последовательностей. По силе сцепления можно оценить степень комплементарности зонда и искомой молекулы.
Миссенс-мутация - мутация, из-за которой меняется структура белка и его функции нарушаются или утрачиваются.
Моноклональные антитела вырабатываются одним клоном клеток (обычно гибридомой ), высоко специфичны для определенного антигена.
мРНК - РНК после удаления интронов, готовая к трансляции (синтезу белка).
Нуклеозиды - пуриновые азотистые основания и пиримидиновые азотистые основания , соединенные с остатком рибозы (для РНК) или дезоксирибозы (для ДНК).
Нуклеотиды - нуклеозиды , соединенные с фосфатными группами.
Онкогены - гены, вызывающие опухолевое перерождение клетки.
Передача сигнала - механизм, с помощью которого внеклеточные молекулы влияют на внутриклеточные процессы. Он необходим для роста и дифференцировки клеток в многоклеточных организмах.
Промотор участок ДНК вблизи гена, с которого начинается транскрипция .
Протоонкогены - нормальные гены, гомологичные вирусным или клеточным онкогенам; обычно они кодируют белки, регулирующие деление и дифференцировку клетки. Названия генов пишут курсивом, генов человека - прописными буквами (RAS), вирусов - строчными (tat), белков - с прописной буквы и обычным шрифтом (Ras).
ПЦР - метод для получения большого количества копий небольших фрагментов ДНК.
Транскрипция - синтез комплементарной РНК на матрице ДНК.
Трансляция - синтез белка на рибосомах в цитоплазме, матрицей служит мРНК .
Трансфекция - внедрение в геном клетки чужеродной ДНК. Ряд вирусных онкогенов были открыты путем трансфекции ДНК из опухолевых клеток в здоровые. После нескольких делений утрачивается вся чужеродная ДНК, кроме онкогенов.
Факторы транскрипции - белки, которые связываются с регуляторными участками генов. Выделяют несколько семейств этих белков, содержащих структуры типа "спираль-петля-спираль", "спираль-поворот-спираль", "лейциновая застежка".
Хромосомные аберрации ( инверсии , транслокации , вставки ) - нарушения, способные затронуть гены, регулирующие пролиферацию, и вызвать опухолевый рост. Некоторые аберрации специфичны для определенных опухолей.
Циклины - белки, запускающие клеточный цикл путем активации транскрипции онкогенов МУС и MOS , которые стимулируют синтез ДНК.
Экзон - участок гена, кодирующий последовательность аминокислот.
BCR-ABL1 - химерный ген, который несет филадельфийская хромосома при ХМЛ . BCR (breakpoint cluster region) - это участок хромосомы, где обычно происходят транслокации . Такой участок находится рядом с PDGFB геном на 22-й хромосоме и в результате транслокации соединяется с ABL1 геном (кодирует мембранную тирозинкиназу) на 9-й хромосоме . Заражение мышей ретровирусами, содержащими ген BCR-ABL1, индуцирует ХМЛ.
CD - поверхностные антигены лейкоцитов, их набор меняется по мере созревания. С помощью моноклональных антител к CD можно определить вид и дифференцировку лейкоцита. При гемобластозах этот метод помогает уточнить диагноз и оценить прогноз.
Вирусная РНК . Ретровирусы содержат 2 одинаковых цепи РНК, несущие гены pol , gag и env , а также ряд специфичных генов, регулирующих экспрессию генов и воспроизводство вируса, например tax ген y Т-лимфотропного вируса человека типа 1 или tat ген у ВИЧ .
Вирусные онкогены гомологичны нормальным генам клетки, вызывают ее трансформацию.
Вирусы, не способные к репродукции , - вирусы, утратившие те или иные гены, необходимые для воспроизводства. Обычно такие вирусы содержат онкогены и быстро вызывают опухолевую трансформацию у животных и в культуре клеток. Вирусы, способные к репродукции , - содержат все гены, необходимые для воспроизводства.
Внешняя оболочка ( суперкапсид ) вируса включает двойной слой липидов и белков, образуется из мембраны зараженной клетки и вирусных белков, кодируемых env геном . При заражении клетки эти белки связываются с рецепторами клеточной мембраны. Например, белки ВИЧ связываются с рецепторами CD4 Т-хелперов .
Длинные концевые повторы - последовательности, облегчающие вирусной ДНК встраивание в геном клетки. Они обозначают начальную и конечную точки при транскрипции.
Капсид - белковая оболочка вируса, кодируется gag геном .
Короткие концевые повторы находятся на концах вирусной РНК, обратная транскриптаза превращает их в длинные концевые повторы ДНК.
Обратная транскриптаза - ДНК-полимераза ретровирусов , синтезирует двухцепочечную ДНК на матрице РНК. Кодируется роl геном , находится в сердцевине вируса.
Провирус - ДНК, синтезируемая на матрице ретровирусной РНК.
Смотрите также:
